MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS2096 chromosome

Total Repeats: 39561

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008023	ATTT	2	8	91	98	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008023	ACTA	2	8	117	124	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_008023	AAG	2	6	187	192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008023	T	6	6	221	226	0 %	100 %	0 %	0 %	94991498
5	NC_008023	T	6	6	280	285	0 %	100 %	0 %	0 %	94991498
6	NC_008023	ATG	2	6	290	295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991498
7	NC_008023	A	7	7	365	371	100 %	0 %	0 %	0 %	94991498
8	NC_008023	CTG	2	6	392	397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94991498
9	NC_008023	GAA	2	6	442	447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991498
10	NC_008023	ATCA	2	8	478	485	50 %	25 %	0 %	25 %	94991498
11	NC_008023	AGC	2	6	494	499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94991498
12	NC_008023	TGC	2	6	594	599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94991498
13	NC_008023	TTA	2	6	682	687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991498
14	NC_008023	AT	3	6	738	743	50 %	50 %	0 %	0 %	94991498
15	NC_008023	TTA	2	6	758	763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991498
16	NC_008023	GAAA	2	8	807	814	75 %	0 %	25 %	0 %	94991498
17	NC_008023	TGA	2	6	843	848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991498
18	NC_008023	A	7	7	865	871	100 %	0 %	0 %	0 %	94991498
19	NC_008023	CT	3	6	874	879	0 %	50 %	0 %	50 %	94991498
20	NC_008023	AAG	2	6	887	892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991498
21	NC_008023	ATA	3	9	920	928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94991498
22	NC_008023	ACAA	2	8	929	936	75 %	0 %	0 %	25 %	94991498
23	NC_008023	ATC	2	6	965	970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94991498
24	NC_008023	AGA	2	6	981	986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991498
25	NC_008023	CCT	2	6	1033	1038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94991498
26	NC_008023	CAAA	2	8	1194	1201	75 %	0 %	0 %	25 %	94991498
27	NC_008023	TGC	2	6	1224	1229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94991498
28	NC_008023	GAA	2	6	1285	1290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991498
29	NC_008023	CTA	2	6	1343	1348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94991498
30	NC_008023	TGG	2	6	1443	1448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94991498
31	NC_008023	TAA	2	6	1479	1484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94991498
32	NC_008023	A	6	6	1539	1544	100 %	0 %	0 %	0 %	94991498
33	NC_008023	AAC	2	6	1605	1610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_008023	TC	3	6	1626	1631	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_008023	TTTA	2	8	1633	1640	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008023	TA	3	6	1652	1657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008023	CTA	4	12	1666	1677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_008023	TTA	3	9	1679	1687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008023	TTA	2	6	1691	1696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008023	ATT	2	6	1738	1743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991499
41	NC_008023	TCA	2	6	1805	1810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94991499
42	NC_008023	GTAA	2	8	1889	1896	50 %	25 %	25 %	0 %	94991499
43	NC_008023	TTA	2	6	1937	1942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991499
44	NC_008023	T	7	7	1951	1957	0 %	100 %	0 %	0 %	94991499
45	NC_008023	ATT	2	6	1964	1969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991499
46	NC_008023	AAC	2	6	2010	2015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94991499
47	NC_008023	GTT	2	6	2021	2026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94991499
48	NC_008023	AAG	2	6	2091	2096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991499
49	NC_008023	ATT	2	6	2131	2136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991499
50	NC_008023	TAT	2	6	2143	2148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991499
51	NC_008023	GTC	2	6	2184	2189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94991499
52	NC_008023	GACT	2	8	2248	2255	25 %	25 %	25 %	25 %	94991499
53	NC_008023	CAG	2	6	2298	2303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94991499
54	NC_008023	GA	3	6	2335	2340	50 %	0 %	50 %	0 %	94991499
55	NC_008023	CAG	2	6	2346	2351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94991499
56	NC_008023	GAT	2	6	2360	2365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991499
57	NC_008023	TTA	2	6	2474	2479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991499
58	NC_008023	GTT	2	6	2501	2506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94991499
59	NC_008023	CTT	2	6	2545	2550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94991499
60	NC_008023	GGTAA	2	10	2636	2645	40 %	20 %	40 %	0 %	94991499
61	NC_008023	AGTC	2	8	2666	2673	25 %	25 %	25 %	25 %	94991499
62	NC_008023	GAA	2	6	2804	2809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991499
63	NC_008023	AATT	2	8	2820	2827	50 %	50 %	0 %	0 %	94991499
64	NC_008023	TAAG	2	8	2846	2853	50 %	25 %	25 %	0 %	94991499
65	NC_008023	T	7	7	2874	2880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008023	TTA	2	6	2882	2887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008023	ATA	2	6	2900	2905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008023	TGAAA	2	10	2946	2955	60 %	20 %	20 %	0 %	94991500
69	NC_008023	A	6	6	2953	2958	100 %	0 %	0 %	0 %	94991500
70	NC_008023	ATG	2	6	3067	3072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991500
71	NC_008023	A	7	7	3099	3105	100 %	0 %	0 %	0 %	94991500
72	NC_008023	TAAA	2	8	3130	3137	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008023	A	6	6	3172	3177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008023	AGA	2	6	3223	3228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008023	AAT	2	6	3301	3306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008023	TCT	2	6	3373	3378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_008023	TCT	2	6	3395	3400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_008023	T	6	6	3402	3407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008023	TAA	2	6	3412	3417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008023	TTGA	2	8	3420	3427	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008023	CAG	2	6	3460	3465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94991501
82	NC_008023	GCT	2	6	3534	3539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94991501
83	NC_008023	TGGTA	2	10	3572	3581	20 %	40 %	40 %	0 %	94991501
84	NC_008023	A	7	7	3630	3636	100 %	0 %	0 %	0 %	94991501
85	NC_008023	AAAT	2	8	3710	3717	75 %	25 %	0 %	0 %	94991501
86	NC_008023	TGA	3	9	3770	3778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991501
87	NC_008023	TCAA	2	8	3876	3883	50 %	25 %	0 %	25 %	94991501
88	NC_008023	A	6	6	3904	3909	100 %	0 %	0 %	0 %	94991501
89	NC_008023	AGA	2	6	4016	4021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991501
90	NC_008023	GTT	2	6	4032	4037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94991501
91	NC_008023	AAC	2	6	4055	4060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94991501
92	NC_008023	CAAA	2	8	4130	4137	75 %	0 %	0 %	25 %	94991501
93	NC_008023	AGT	2	6	4169	4174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991501
94	NC_008023	AGA	2	6	4193	4198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991501
95	NC_008023	AGA	2	6	4229	4234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991501
96	NC_008023	AGC	2	6	4286	4291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94991501
97	NC_008023	ATC	2	6	4294	4299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94991501
98	NC_008023	CAG	2	6	4324	4329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94991501
99	NC_008023	GCT	2	6	4383	4388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94991501
100	NC_008023	TAT	2	6	4391	4396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991501
101	NC_008023	ATG	2	6	4444	4449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991501
102	NC_008023	AAG	2	6	4483	4488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991501
103	NC_008023	GAA	2	6	4503	4508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991501
104	NC_008023	TGT	2	6	4520	4525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94991501
105	NC_008023	CAT	2	6	4538	4543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94991501
106	NC_008023	GAA	2	6	4593	4598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991502
107	NC_008023	TTG	2	6	4648	4653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94991502
108	NC_008023	A	6	6	4681	4686	100 %	0 %	0 %	0 %	94991502
109	NC_008023	GAT	2	6	4752	4757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991502
110	NC_008023	TTA	2	6	4789	4794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991502
111	NC_008023	CTA	2	6	4822	4827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94991502
112	NC_008023	AAT	2	6	4836	4841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94991502
113	NC_008023	CTA	2	6	4871	4876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94991502
114	NC_008023	ATG	2	6	4909	4914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991502
115	NC_008023	TTACGT	2	12	4938	4949	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	94991502
116	NC_008023	CAG	2	6	4960	4965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94991502
117	NC_008023	GAC	2	6	5041	5046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94991502
118	NC_008023	TTA	2	6	5065	5070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991502
119	NC_008023	ATA	2	6	5101	5106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94991502
120	NC_008023	TTTA	2	8	5152	5159	25 %	75 %	0 %	0 %	94991502
121	NC_008023	A	6	6	5176	5181	100 %	0 %	0 %	0 %	94991502
122	NC_008023	ATT	2	6	5221	5226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991503
123	NC_008023	ACC	2	6	5267	5272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94991503
124	NC_008023	GAT	2	6	5342	5347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991503
125	NC_008023	A	9	9	5349	5357	100 %	0 %	0 %	0 %	94991503
126	NC_008023	TGA	2	6	5422	5427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991503
127	NC_008023	T	6	6	5444	5449	0 %	100 %	0 %	0 %	94991503
128	NC_008023	TGA	2	6	5673	5678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991503
129	NC_008023	TTA	2	6	5706	5711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991503
130	NC_008023	T	6	6	5789	5794	0 %	100 %	0 %	0 %	94991503
131	NC_008023	TGA	2	6	5797	5802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991503
132	NC_008023	AAC	2	6	5850	5855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94991503
133	NC_008023	TTA	2	6	5868	5873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991503
134	NC_008023	GAT	2	6	5957	5962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991503
135	NC_008023	A	6	6	5963	5968	100 %	0 %	0 %	0 %	94991503
136	NC_008023	AGA	2	6	5977	5982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991503
137	NC_008023	A	6	6	5998	6003	100 %	0 %	0 %	0 %	94991503
138	NC_008023	ATT	2	6	6040	6045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991503
139	NC_008023	ATT	2	6	6064	6069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991503
140	NC_008023	T	6	6	6098	6103	0 %	100 %	0 %	0 %	94991503
141	NC_008023	GAT	2	6	6104	6109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991503
142	NC_008023	GATTT	2	10	6138	6147	20 %	60 %	20 %	0 %	94991503
143	NC_008023	AGA	2	6	6169	6174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991503
144	NC_008023	ACT	2	6	6207	6212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94991503
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146	NC_008023	T	6	6	6338	6343	0 %	100 %	0 %	0 %	94991503
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151	NC_008023	AGTG	2	8	6481	6488	25 %	25 %	50 %	0 %	94991503
152	NC_008023	TGA	2	6	6556	6561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991503
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163	NC_008023	TGA	3	9	7018	7026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991503
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270	NC_008023	A	6	6	11246	11251	100 %	0 %	0 %	0 %	94991508
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272	NC_008023	TGA	2	6	11308	11313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991508
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409	NC_008023	A	7	7	16765	16771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
410	NC_008023	TAA	2	6	16804	16809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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413	NC_008023	A	6	6	16844	16849	100 %	0 %	0 %	0 %	94991513
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433	NC_008023	AT	3	6	17749	17754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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446	NC_008023	CGC	2	6	18409	18414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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457	NC_008023	TAA	2	6	18974	18979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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